Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDPD3Q7L5L3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms