Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMUB2Q71RG4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMUB2Q71RG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms