Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q71RC1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q71RC1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q71RC1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q71RC1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q71RC1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q71RC1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q71RC1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms