Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C12orf54Q6X4T0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms