Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms