Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H3

CEP85, Centrosomal protein of 85 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP85Q6P2H3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP85Q6P2H3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP85Q6P2H3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms