Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ANKRD54Q6NXT1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ANKRD54Q6NXT1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms