Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYW3Q6IPR3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms