Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF123Q5XPI4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms