Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms