Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND3Q5T5X7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms