Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms