Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMPD1Q5SYB0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms