Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms