Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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KHDC3LQ587J8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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KHDC3LQ587J8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KHDC3LQ587J8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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