Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDLIM3Q53GG5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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