Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPP1Q1MSJ5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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