Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms