Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDR2Q16832 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR2Q16832 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms