Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SNCBQ16143 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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