Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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