Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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