Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF13Q15543 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms