Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDSNQ15517 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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