Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCAPD2Q15021 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms