Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM53BQ14153 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms