Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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