Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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