Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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