Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOFQ13790 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOFQ13790 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms