Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms