Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms