Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PICALMQ13492 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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