Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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