Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms