Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ERCC8Q13216 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ERCC8Q13216 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ERCC8Q13216 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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ERCC8Q13216 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ERCC8Q13216 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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