Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAF1AQ13111 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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