Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN2AQ12879 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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