Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms