Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLEQ07864 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms