Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms