Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms