Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACVR1Q04771 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms