Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms