Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 S100Z-202ENST00000513010 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AP000350.5-201ENST00000609825 613 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB1Q02641 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms