Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DSG1Q02413 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms