Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF17Q02223 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms