Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms