Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms