Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms